Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn6Q99PL6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn6Q99PL6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms