Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms