Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms