Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms