Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms