Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms