Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99KU6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99KU6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99KU6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99KU6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99KU6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99KU6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms