Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab28Q99KL7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms