Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms