Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms