Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kdelr1Q99JH8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms