Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Lmo1Q924W9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lmo1Q924W9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lmo1Q924W9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lmo1Q924W9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lmo1Q924W9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Lmo1Q924W9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Lmo1Q924W9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Lmo1Q924W9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lmo1Q924W9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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