Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf3Q922U1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms