Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhga12Q91XY7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms