Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms