Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms