Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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