Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCX6

Kptn, KICSTOR complex protein kaptin, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KptnQ8VCX6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KptnQ8VCX6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KptnQ8VCX6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms