Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Dnaaf4Q8R368 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf4Q8R368 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms