Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms