Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltbp4Q8K4G1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp4Q8K4G1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms