Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ssh3Q8K330 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ssh3Q8K330 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Ssh3Q8K330 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ssh3Q8K330 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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