Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hacd3Q8K2C9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hacd3Q8K2C9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms