Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtmr3Q8K296 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtmr3Q8K296 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms