Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Abcf3Q8K268 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Abcf3Q8K268 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Abcf3Q8K268 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Abcf3Q8K268 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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