Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms