Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms