Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FgbQ8K0E8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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