Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms