Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Znf628Q8CJ78 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms