Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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