Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Csnka2ipQ8CH19 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Csnka2ipQ8CH19 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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