Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms