Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cwc22Q8C5N3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms