Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms