Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FarsaQ8C0C7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FarsaQ8C0C7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FarsaQ8C0C7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FarsaQ8C0C7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FarsaQ8C0C7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FarsaQ8C0C7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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FarsaQ8C0C7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FarsaQ8C0C7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FarsaQ8C0C7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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