Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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