Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn17Q8BXA6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn17Q8BXA6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn17Q8BXA6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cldn17Q8BXA6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms