Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp38Q8BW70 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp38Q8BW70 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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