Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms