Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms