Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms