Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm5bQ80Y84 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms