Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rims3Q80U57 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms