Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms