Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ClmQ7TSN2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms