Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms