Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms