Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim46Q7TNM2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim46Q7TNM2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim46Q7TNM2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim46Q7TNM2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim46Q7TNM2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim46Q7TNM2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim46Q7TNM2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms