Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms